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Tipo file File di allineamento compresso
Cos'è un file CRAM?
Formato di file di allineamento compresso sviluppato da EBI, una stazione periferica del laboratorio europeo di biologia molecolare; memorizza gli allineamenti di lettura della sequenza DNA breve generati da allineatori a lettura breve come BWA, BBMap e BLAT. Maggiori informazioni
Il formato del file CRAM è simile al formato file Binary Alignment / Map (BAM) ma offre una migliore compressione dei file e un formato contenitore binario orientato alle colonne ristrutturato. Con l'aumento dei volumi di dati nel campo del software genetico, il formato CRAM è stato progettato per ridurre la stampa del piede del disco dei dati di allineamento.
L'allineamento di lettura breve è il processo di decifrazione da cui proviene una sequenza nel genoma. Questo può essere difficile poiché il genoma di riferimento è piuttosto grande e non si cercano sempre corrispondenze esatte nel genoma di riferimento. Brevi allineatori di lettura sono usati per cercare sequenze enormi per le partite e le partite ravvicinate. Poiché le sequenze sono così grandi, la compressione fornita da formati come CRAM è necessaria per mantenere le dimensioni dei file gestibili.
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Informazioni sui file CRAM
Il nostro obiettivo è aiutarti a capire che cos'è un file con un suffisso * .cram e come aprirlo.
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